Nhận đối tượng cụ thể từ các rdata nộp

Question

Tôi có một tập tin Rdata chứa các đối tượng khác nhau:

New.Rdata 
    |_ Object 1 (e.g. data.frame) 
    |_ Object 2 (e.g. matrix) 
    |_... 
    |_ Object n 

Dĩ nhiên tôi có thể tải các khung dữ liệu với load('New.Rdata') Tuy nhiên, có một cách thông minh để tải chỉ có một đối tượng cụ thể ra của tệp này và loại bỏ các tệp khác?

Answer 1

. Tệp dữ liệu không có chỉ mục (nội dung được đăng theo thứ tự là một danh sách cặp đôi lớn). Bạn có thể hack một cách để đi qua các cặp đôi và chỉ gán mục bạn thích, nhưng nó không phải dễ dàng vì bạn không thể làm điều đó ở cấp R.

Tuy nhiên, bạn chỉ có thể chuyển đổi tệp .RData thành cơ sở dữ liệu tải lười, nối tiếp từng mục nhập riêng biệt và tạo chỉ mục. Điều tốt đẹp là tải sẽ theo yêu cầu:

# convert .RData -> .rdb/.rdx 
e = local({load("New.RData"); environment()}) 
tools:::makeLazyLoadDB(e, "New") 

Tải DB sau đó chỉ tải chỉ mục chứ không tải nội dung. Nội dung được nạp khi chúng được sử dụng:

lazyLoad("New") 
ls() 
x # if you had x in the New.RData it will be fetched now from New.rdb 

Cũng giống như với load() bạn có thể chỉ ra một môi trường để nạp vào, do đó bạn không cần phải làm ô nhiễm không gian làm việc toàn cầu, vv

Answer 2

Bạn có thể sử dụng attach thay hơn load sẽ đính kèm đối tượng dữ liệu vào đường dẫn tìm kiếm, sau đó bạn có thể sao chép một đối tượng mà bạn quan tâm và tách đối tượng .Rdata.

Điều này vẫn tải mọi thứ, nhưng đơn giản hơn khi tải mọi thứ vào không gian làm việc toàn cầu (có thể ghi đè lên những thứ bạn không muốn ghi đè) rồi loại bỏ mọi thứ bạn không muốn.

Answer 3

Câu trả lời của Simon Urbanek rất, rất hay. Một nhược điểm là nó dường như không có tác dụng nếu một đối tượng được cứu rỗi là quá lớn:

tools:::makeLazyLoadDB(
    local({ 
    x <- 1:1e+09 
    cat("size:", object.size(x) ,"\n") 
    environment() 
    }), "lazytest") 
size: 4e+09 
Error: serialization is too large to store in a raw vector 

Tôi đoán rằng điều này là do một hạn chế của việc thực hiện hiện tại của R (Tôi có 2.15. 2) thay vì hết bộ nhớ vật lý và trao đổi. Tuy nhiên, gói saves có thể là một thay thế cho một số ứng dụng.