Tôi muốn sử dụng hclust để nhóm dữ liệu. Nhưng tôi không muốn sử dụng "dist()" để tạo đối tượng dist. Sau đó, tôi phát hiện ra rằng tôi không thể vượt qua một ma trận đối xứng như ma trận khoảng cách vào hclust.Làm thế nào để chuyển đổi ma trận đối xứng thành đối tượng "dist"?
Làm thế nào để chuyển đổi ma trận đối xứng thành đối tượng "dist"?
Có vẻ như bạn đã có ma trận được tính toán và muốn sử dụng ma trận đó trong hclust. Giống như @shadow đã nói, bạn có thể sử dụng as.dist(yourMatrix) để chuyển đổi sang định dạng phân phối.
Cho một bảng đối xứng của khoảng cách:
> yourMatrix<-matrix(c(1,2,3,4,2,1,2,1,3,2,1,3,4,1,3,1), nrow=4)
[,1] [,2] [,3] [,4]
[1,] 1 2 3 4
[2,] 2 1 2 1
[3,] 3 2 1 3
[4,] 4 1 3 1
>
>as.dist(yourMatrix)
1 2 3
2 2
3 3 2
4 4 1 3
Hãy chắc chắn rằng các giá trị trong ma trận của bạn là không giống nhau hoặc các số liệu khoảng cách chứ không phải là điểm tương đồng.
Đây có phải là những gì bạn cần không? dist(matrix(1:16, nrow=4))