sự khác biệt giữa doMC và doParallel trong R

Question

Sự khác biệt giữa doParallel và doMC trong R có liên quan đến chức năng foreach? doParallel hỗ trợ các cửa sổ, giống như Unix, trong khi doMC chỉ hỗ trợ kiểu tự động. Nói cách khác, tại sao doParallel không thể thay thế trực tiếp doMC? Cảm ơn bạn.

Cập nhật: doParallel được xây dựng trên parallel, trong đó chủ yếu là sáp nhập multicore và snow và tự động sử dụng công cụ thích hợp cho hệ thống của bạn. Do đó, chúng tôi có thể sử dụng doParallel để hỗ trợ nhiều hệ thống. Nói cách khác, chúng tôi có thể sử dụng doParallel để thay thế doMC.

ref: http://michaeljkoontz.weebly.com/uploads/1/9/9/4/19940979/parallel.pdf

BTW, sự khác biệt là gì giữa registerDoParallel(ncores=3) và

cl <- makeCluster(3) 
registerDoParallel(cl) 

Dường registerDoParallel(ncores=3) có thể ngăn chặn cụm tự động, trong khi thứ hai không dừng tự động và cần stopCluster(cl).

ref: http://cran.r-project.org/web/packages/doParallel/vignettes/gettingstartedParallel.pdf

Answer 1

Gói doParallel là một sáp nhập doSNOW và doMC, nhiều càng parallel là một sáp nhập snow và multicore. Nhưng mặc dù doParallel có tất cả các tính năng của doMC, tôi đã được Rich Calaway of Revolution Analytics kể rằng họ muốn giữ nguyên hiệu quả hơn trong một số trường hợp, mặc dù doMC hiện sử dụng parallel giống như doParallel. Cá nhân tôi chưa chạy bất kỳ điểm chuẩn nào để xác định xem liệu có khi nào có sự khác biệt đáng kể hay không.

tôi có xu hướng sử dụng doMC trên Linux hoặc Mac OS X máy tính, doParallel trên một máy tính Windows, và doMPI trên một cụm Linux, nhưng doParallel làm việc trên tất cả các nền tảng.

---

Đối với các phương pháp đăng ký khác nhau, nếu bạn thực hiện:

registerDoParallel(cores=3) 

trên một máy Windows, nó sẽ tạo ra một đối tượng cụm ngầm để sử dụng sau với clusterApplyLB, trong khi trên Linux và Mac OS X , không có đối tượng cụm nào được tạo hoặc sử dụng. Số lượng lõi đơn giản được ghi nhớ và sử dụng làm giá trị của đối số mc.cores sau đó khi gọi mclapply.

Nếu bạn thực hiện:

cl <- makeCluster(3) 
registerDoParallel(cl) 

sau đó các đối tượng cụm đăng ký sẽ được sử dụng với clusterApplyLB bất kể nền tảng này. Bạn đúng là trong trường hợp này, bạn có trách nhiệm tắt đối tượng cụm từ khi bạn tạo nó, trong khi đối tượng cụm ẩn sẽ tự động tắt.