Làm thế nào để tìm ra nơi xảy ra lỗi R?

Question

Đôi khi R ném tôi lỗi như

Lỗi trong if (ncol (x) = 2!) {: Đối số là chiều dài không

không có thêm thông tin, khi tôi đã viết không có mã như vậy. Có cách nào chung để tìm ra hàm nào trong đó gói gây ra lỗi?

Vì hầu hết các gói đều được nén, nó không tầm thường đối với grep /usr/lib/R/library.

Answer 1

Bạn có thể sử dụng traceback() để xác định vị trí xảy ra lỗi cuối cùng. Thông thường nó sẽ chỉ cho bạn một cuộc gọi bạn thực hiện trong chức năng của bạn. Sau đó, tôi thường đặt browser() vào thời điểm đó, chạy lại chức năng và xem điều gì đang xảy ra.

Ví dụ, đây là hai chức năng:

f2 <- function(x) 
{ 
    if (x==1) "foo" 
} 

f <- function(x) 
{ 
    f2(x) 
} 

Lưu ý rằng f2() giả định một cuộc tranh cãi về chiều dài 1. Chúng ta có thể lạm dụng f:

> f(NULL) 
Error in if (x == 1) "foo" : argument is of length zero 

Bây giờ chúng ta có thể sử dụng traceback() để xác định vị trí những gì đã xảy ra:

> traceback() 
2: f2(x) at #3 
1: f(NULL) 

Số nghĩa sâu như thế nào chúng tôi đang trong chức năng lồng nhau. Vì vậy, chúng tôi thấy rằng các cuộc gọi ff2 và có lỗi ở dòng 3. Khá rõ ràng. Chúng tôi có thể chỉ định lại f với browser được đặt ngay trước khi gọi f2 ngay bây giờ để kiểm tra đầu vào của nó. browser() chỉ đơn giản là cho phép bạn ngừng thực hiện một chức năng và nhìn xung quanh trong môi trường của nó. Tương tự như debug và debugonce ngoại trừ việc bạn không phải thực thi mọi dòng cho đến thời điểm bạn biết có điều gì đó không ổn.

Answer 2

Chỉ cần thêm vào những gì @SachaEpskamp đã đề xuất, thiết lập options(error=recover) và options(show.error.locations=TRUE) có thể cực kỳ hữu ích khi gỡ lỗi mã không quen thuộc. Nguyên nhân đầu tiên R là khởi chạy phiên gỡ lỗi do lỗi, cho bạn tùy chọn gọi trình duyệt tại bất kỳ điểm nào trong ngăn xếp cuộc gọi đến lỗi đó. Tùy chọn thứ hai sẽ cho R biết bao gồm số dòng nguồn trong lỗi.