R Markdown - tên đầu ra biến

Question

Với một tệp đánh dấu R, tôi muốn tạo các tài liệu pdf đầu ra có thể khác nhau, trong đó tên tệp đầu ra phải được xác định trong tài liệu. Có cách nào để thuyết phục markdown để thao tác các tên tập tin đầu ra theo cách như vậy? Lý tưởng nhất là tôi muốn chuyển tên tệp bằng một đoạn r.

Answer 1

Bạn có thể giữ sự đơn giản của việc sử dụng các Knit nút RStudio và độ tái lập của một tiêu đề YAML bằng công không có giấy tờ knit móc để xác định lại chức năng của nút không (chức năng mặc định được gọi là rmarkdown::render). Tham số output_file của hàm render chỉ định tên tệp, do đó, bằng cách đặt nó, bạn ghi đè hành vi chuẩn của việc sử dụng cùng một tiền tố làm tên tệp đầu vào.

ví dụ: luôn ra một tập tin gọi là myfile.pdf

knit: (function(inputFile, encoding) { rmarkdown::render(inputFile, encoding = encoding, output_file = file.path(dirname(inputFile), 'myfile.pdf')) }) 

Chức năng có thể là một ẩn danh one-liner cũng như nhập khẩu từ một gói, như đã thấy here với slidify.

Bạn có thể đặt tiêu đề YAML của riêng mình (tôi không biết điều này thường được thông báo hay không), có thể truy cập dưới rmarkdown::metadata$newheader nhưng chúng dường như không có sẵn trong phạm vi chức năng này như tôi thấy.

Để chuyển tên tệp từ một đoạn R ... nếu bạn đang đề cập đến các khối mã bên dưới tiêu đề YAML, từ kinh nghiệm của tôi, tôi không nghĩ rằng có thể (?). Tiêu đề có thể chứa các lệnh R nội tuyến (một dấu backtick đơn, bắt đầu bằng r), nhưng dường như không phải cho hàm móc này.

liên quan:

• Rmarkdown GitHub repo vấn đề - output format-specific output_file
• Blog bài tôi đã viết sau câu hỏi này on more elaborate uses of the knit: hook/tương ứng GitHub wiki notes

Answer 2

này là khá nhiều những gì tôi làm:

rmarkdown::render('my_markdown_report.Rmd', 
        output_file = paste('report.', Sys.Date(), 
             '.pdf', sep='')) 

tôi có ba kịch bản - một kéo dữ liệu và xử lý nó, thứ hai tạo ra bảng xếp hạng & bảng cho báo cáo. Thứ ba tạo báo cáo dựa trên tệp đánh dấu. Mã bạn nhìn thấy ở trên là một phần của kịch bản thứ ba

Answer 3

Theo dõi vào những gì @ilya viết, trang web này có một ví dụ tuyệt vời thể hiện những gì họ mô tả, đó là cách tạo nhiều báo cáo có thể tái sản xuất từ ​​cùng một tài liệu .Rmd :

http://www.reed.edu/data-at-reed/software/R/markdown_multiple_reports.html

Trang web sử dụng hai kịch bản, một kịch bản R và một kịch bản Rmarkdown để tạo ra nhiều báo cáo. Tôi đã sử dụng nó như là một mẫu cho công việc của riêng tôi và thấy nó rất hữu ích.