Chuyển toàn bộ gói đến cụm tuyết

Question

Tôi đang cố gắng song song (sử dụng snow::parLapply) một số mã phụ thuộc vào gói (ví dụ: gói không phải là snow). Các đối tượng được tham chiếu trong hàm được gọi là parLapply phải được chuyển một cách rõ ràng đến cụm bằng cách sử dụng clusterExport. Có cách nào để chuyển toàn bộ gói tới cụm thay vì phải đặt tên rõ ràng mọi chức năng (bao gồm chức năng nội bộ của gói được gọi bởi các hàm người dùng!) Trong clusterExport?

Answer 1

Cài đặt gói trên tất cả các nút, và có cuộc gọi mã của bạn library(thePackageYouUse) trên tất cả các nút thông qua một trong các lệnh có sẵn, một cái gì đó trứng như

clusterApply(cl, library(thePackageYouUse)) 

Tôi nghĩ rằng gói parallel mà đi kèm với phiên bản R gần đây có các ví dụ - - xem ví dụ tại đây từ help(clusterApply) trong đó gói boot được tải ở mọi nơi:

## A bootstrapping example, which can be done in many ways: 
clusterEvalQ(cl, { 
    ## set up each worker. Could also use clusterExport() 
    library(boot) 
    cd4.rg <- function(data, mle) MASS::mvrnorm(nrow(data), mle$m, mle$v) 
    cd4.mle <- list(m = colMeans(cd4), v = var(cd4)) 
    NULL 
})