Tôi có một khung dữ liệu 200 cột chứa 150 gen (hàng) trong mỗi cột.đếm số lần xuất hiện trong data.frame trong r
Tôi muốn đếm số lần xuất hiện số cho mỗi gen trong khung dữ liệu toàn
mydat <-
V1 V2 V3 V4 V5 V6 V7 V8
1 TGFBR2 TGFBR2 TGFBR2 TGFBR2 TGFBR2 TGFBR2 TGFBR2 TGFBR2
2 MAML2 MAML2 MAML2 MAML2 MAML2 MAML2 MAML2 MAML2
3 BMPR2 EIF5A WRAP53 WRAP53 EIF5A EIF5A EIF5A EIF5A
4 EIF5A BMPR2 EIF5A EIF5A ADAMTSL3 BMPR2 WRAP53 BMPR2
5 EIF5AL1 WRAP53 ADAMTSL3 BMPR2 BMPR2 WRAP53 BMPR2 EIF5AL1
6 WRAP53 EIF5AL1 BMPR2 ADAMTSL3 WRAP53 EIF5AL1 EIF5AL1 WRAP53
7 TBC1D5 ADAMTSL3 EIF5AL1 EIF5AL1 EIF5AL1 ADAMTSL3 ADAMTSL3 C1QTNF7
8 ADAMTSL3 C1QTNF7 C1QTNF7 C1QTNF7 FHL1 YAP1 AURKB ADAMTSL3
9 C1QTNF7 FHL1 RGS7BP LIFR C1QTNF7 TMEM43 C1QTNF7 LIFR
10 AURKB RGS5 AURKB FAM198B AURKB C1QTNF7 PSMB6 PDGFD
Vì vậy, tôi muốn đầu ra được một cái gì đó như thế này:
occurences
TGFBR2: 8
MALM2 : 8
FHL1: 3
vv Nhưng tôi muốn đếm mọi gen trong khung dữ liệu.
Làm cách nào để thực hiện việc này?
quấn mã gợi ý bởi @CathG và @Sven bởi 'as.data.frame (...)', bạn sẽ nhận được một khung dữ liệu đẹp. – KFB