Chức năng định dạng lại gói R bị lỗi: biến id không tìm thấy trong dữ liệu khi làm việc với nhiều yếu tố

Question

Tôi đang làm việc với một kết quả hiếm hoi từ mothur, về cơ bản cung cấp cho tôi tập dữ liệu chứa số chuỗi được lấy mẫu và số lượng duy nhất trình tự trong một số mẫu. Tôi muốn sử dụng ggplot2 để trực quan hóa dữ liệu này và do đó cần phải sử dụng melt để chuyển từ một định dạng wide sang định dạng long.

Vấn đề là tôi không tìm được cách nào để thực hiện công việc này do lỗi của melt. Mà cơ bản khẳng định

Error: id variables not found in data: 1,3,6, (... and so on)

Do kích thước của tập dữ liệu ban đầu nó sẽ là impractcal để chia sẻ nó ở đây dù sao ta nên có khả năng tái tạo cùng một vấn đề bằng cách sử dụng đoạn mã sau:

a<-seq(0,300,3) 
b<-runif(length(a)) 
c<-runif(length(a)) 
d<-as.data.frame(cbind(a,b,c)) 
d$a<-as.factor(d$a) 
melt(d,d$a) 

mà cung cấp cho chính xác cùng một lỗi:

Error: id variables not found in data: 0,3,6,9, (...)

Tôi không thấy những gì tôi đang làm sai. Tôi đang sử dụng R 2.15.1 trên máy chủ ubuntu 12.04. Cả hàm reshape::melt và reshape2::melt dẫn đến cùng một lỗi.

Answer 1

Bạn nên sử dụng:

melt(d, id.vars="a") 
     a variable  value 
1  0  b 0.019199459 
2  3  b 0.693699677 
3  6  b 0.937592641 
4  9  b 0.299259963 
5 12  b 0.485403439 
... 

---

Từ sự giúp đỡ của ?melt.data.frame:

data
data frame to melt

id.vars
vector of id variables. Can be integer (variable position) or string (variable name)If blank, will use all non-measured variables

Như vậy lập luận id.vars của bạn nên là một vector đặc trưng của tên, ví dụ "a" hoặc vectơ số, ví dụ: 1. Độ dài của vectơ này phải bằng số cột bạn muốn làm id.

Thay vào đó, bạn đã sử dụng một yếu tố có chứa nhiều yếu tố hơn bạn có các cột trong dữ liệu của mình.