Có thứ gì đó như requirements.txt cho R không?

Question

Có chức năng như requirements.txt trong Python, nơi bạn có thể lưu trữ danh sách gói được sử dụng vào tệp và bất cứ khi nào người khác muốn chạy chương trình của bạn và cần cài đặt phụ thuộc, họ chỉ có thể thực hiện pip install -r requirements.txt.

Tôi nghĩ, điều này giúp ích rất nhiều khi triển khai tập lệnh R vào sản xuất. Nếu không có chức năng như vậy, làm thế nào để tái tạo nó?

Answer 1

Theo nhận xét, bạn có thể muốn xem xét việc xây dựng một gói và bao gồm các yêu cầu trong tệp DESCRIPTION. Nếu bạn đang nói về việc đặt một kịch bản .R "vào sản xuất", bạn có thể đặt một hàm lúc bắt đầu để đảm bảo các gói yêu cầu được cài đặt. Đây là một cái gì đó dọc theo những dòng mà tôi có trong gói của riêng tôi, và tôi có thể gọi pkgLoad(<list of packages>) ở đầu của bất kỳ kịch bản để đảm bảo các gói được cài đặt và tải. Tôi bao gồm một danh sách các gói yêu thích của tôi, như vậy mà một tiếng gọi của pkgLoad() cài đặt và tải tất cả các nghi phạm thông thường của tôi:

pkgLoad <- function(packages = "favourites") { 

    if(length(packages) == 1L && packages == "favourites") { 
     packages <- c("data.table", "chron", "plyr", "dplyr", "shiny", 
         "shinyjs", "parallel", "devtools", "doMC", "utils", 
         "stats", "microbenchmark", "ggplot2", "readxl", 
         "feather", "googlesheets", "readr", "DT", "knitr", 
         "rmarkdown", "Rcpp" 
     ) 
    } 

    packagecheck <- match(packages, utils::installed.packages()[,1]) 

    packagestoinstall <- packages[ is.na(packagecheck) ] 

    if(length(packagestoinstall) > 0L) { 
     utils::install.packages(packagestoinstall, 
          repos = "http://cran.csiro.au" 
     ) 
    } else { 
     print("All requested packages already installed") 
    } 

    for(package in packages) { 
     suppressPackageStartupMessages(
      library(package, character.only = TRUE, quietly = TRUE) 
     ) 
    } 

} 

Lưu ý tôi đã xây dựng yêu thích gương cran tôi vào chức năng, do đó hãy chắc chắn rằng bạn chỉnh sửa mà cho nhu cầu của riêng bạn.