Grep trích xuất chỉ toàn bộ từ

Question

Tôi có một tệp văn bản lớn. Tôi cần trích xuất tất cả các dòng có chứa từ chính xác "DUSP1". Dưới đây là ví dụ về các dòng:

9606 ENSP00000239223 DUSP1 BLAST 
9606 ENSP00000239223 DUSP1-001 Ensembl 

Tôi muốn truy xuất dòng đầu tiên chứ không phải dòng thứ hai.

Tôi đã thử nhiều lệnh như:

grep -E "^DUSP1" 
grep '\<DUSP1\>' 
grep '^DUSP1$' 
grep -w DUSP1 

Nhưng không ai trong số họ có vẻ làm việc. Tôi nên sử dụng tùy chọn nào?

Answer 1

Sự cố bạn đang gặp phải là dấu gạch ngang (-) được xem là grep làm dấu phân tách từ.

Bạn nên thử lệnh này:

grep '\sDUSP1\s' file 

để đảm bảo rằng có không gian xung quanh từ bạn.

Answer 2

thêm vào những gì sputpick nói, nó có thể một trong hai thể là hay:

grep '\sDUSP1$' file 

nếu DUSP1 là kết thúc của dòng.

Answer 3

Nếu bạn muốn grep chính xác toàn bộ văn bản, bạn có thể sử dụng ranh giới từ như thế này:

grep '\bDUSP1\b' 

này phù hợp cho chính xác từ lúc đầu và lúc kết thúc.