Sử dụng AWK để tìm số nhỏ nhất và lớn nhất trong một cột?

Question

Nếu tôi có một tệp có vài cột và tôi muốn sử dụng lệnh AWK để hiển thị số lớn nhất và số thấp nhất trong một cột cụ thể!

dụ:

a 212 
b 323 
c 23 
d 45 
e 54 
f 102 

Tôi muốn lệnh của tôi để chứng minh rằng số lượng thấp nhất là 23 và lệnh khác để nói rằng số cao nhất là 323

Tôi không có ý tưởng tại sao câu trả lời không làm việc ! Tôi đặt một ví dụ thực tế hơn về tập tin của tôi (có lẽ tôi nên đề cập đến đó là tab xác định)

##FORMAT=<ID=DP,Number=1,Type=Integer,Description="# high-quality bases"> 
##FORMAT=<ID=SP,Number=1,Type=Integer,Description="Phred-scaled strand bias P-value"> 
##FORMAT=<ID=PL,Number=-1,Type=Integer,Description="List of Phred-scaled genotype likelihoods, number of values is (#ALT+1)*(#ALT+2)/2"> 
#CHROM POS  ID  REF  ALT  QUAL FILTER INFO FORMAT rmdup_wl_25248.bam 
Chr10 247  .  T  C  7.8  .  DP=37;AF1=0.5;CI95=0.5,0.5;DP4=7,1,19,0;MQ=15;FQ=6.38;PV4=0.3,1,0.038,1 GT:PL:GQ  0/1:37,0,34:36 
Chr10 447  .  A  C  75  .  DP=30;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,22,5;MQ=14;FQ=-108 GT:PL:GQ  1/1:108,81,0:99 
Chr10 449  .  G  C  35.2 .  DP=33;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=3,2,20,3;MQ=14;FQ=-44;PV4=0.21,1.7e-06,1,0.34  GT:PL:GQ  1/1:68,17,0:31 
Chr10 517  .  G  A  222  .  DP=197;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,128,62;MQ=24;FQ=-282  GT:PL:GQ  1/1:255,255,0:99 
Chr10 761  .  G  A  27  .  DP=185;AF1=0.5;CI95=0.5,0.5;DP4=24,71,8,54;MQ=20;FQ=30;PV4=0.07,8.4e-50,1,1  GT:PL:GQ  0/1:57,0,149:60 
Chr10 1829 .  A  G  3.01 .  DP=74;AF1=0.4998;CI95=0.5,0.5;DP4=18,0,54,0;MQ=19;FQ=4.68;PV4=1,9.1e-12,0.003,1 GT:PL:GQ  0/1:30,0,45:28 

tôi nên nói rằng tôi đã thêm trừ dòng bắt đầu bằng # vì vậy đây là lệnh mà tôi sử dụng:

awk '$1 !~/#/' | awk -F'\t' 'BEGIN{first=1;} {if (first) { max = min = $6; first = 0; next;} if (max < $6) max=$6; if (min > $6) min=$6; } END { print min, max }' wl_25210_filtered.vcf 

awk '$1 !~/#/' | awk -F'\t' 'BEGIN{getline;min=max=$6} NF{ max=(max>$6)?max:$6 min=(min>$6)?$6:min} END{print min,max}' wl_25210_filtered.vcf 

và

awk '$1 !~/#/' | awk -F'\t' ' 
NR==2{min=max=$6;next} 
NR>2 && NF{ 
    max=(max>$6)?max:$6 
    min=(min>$6)?$6:min 
} 
END{print min,max}' wl_25210_filtered.vcf 

Answer 1

Bạn có thể tạo hai hàm do người dùng xác định và sử dụng chúng theo nhu cầu của bạn. Điều này sẽ cung cấp giải pháp chung chung hơn.

[jaypal:~/Temp] cat file 
a 212 
b 323 
c 23 
d 45 
e 54 
f 102 
[jaypal:~/Temp] awk ' 
function max(x){i=0;for(val in x){if(i<=x[val]){i=x[val];}}return i;} 
function min(x){i=max(x);for(val in x){if(i>x[val]){i=x[val];}}return i;} 
{a[$2]=$2;next} 
END{minimum=min(a);maximum=max(a);print "Maximum = "maximum " and Minimum = "minimum}' file 
Maximum = 323 and Minimum = 23 

Trong giải pháp trên, có 2 hàm do người dùng định nghĩa - max và min. Chúng tôi lưu trữ cột 2 trong một mảng. Bạn có thể lưu trữ từng cột của bạn như thế này. Trong câu lệnh END, bạn có thể gọi hàm và lưu trữ giá trị trong một biến và in nó.

Hy vọng điều này sẽ hữu ích!

Cập nhật:

đã thi sau theo ví dụ mới nhất -

[jaypal:~/Temp] awk ' 
function max(x){i=0;for(val in x){if(i<=x[val]){i=x[val];}}return i;} 
function min(x){i=max(x);for(val in x){if(i>x[val]){i=x[val];}}return i;} 
/^#/{next} 
{a[$6]=$6;next} 
END{minimum=min(a);maximum=max(a);print "Maximum = "maximum " and Minimum = "minimum}' sample 
Maximum = 222 and Minimum = 3.01 

Answer 2

awk 'BEGIN{first=1;} 
    {if (first) { max = min = $2; first = 0; next;} 
     if (max < $2) max=$2; if (min > $2) min=$2; } 
    END { print min, max }' file 

Answer 3

Sử dụng BEGIN và END các khối để khởi tạo và in các biến theo dõi phút và tối đa.

ví dụ

awk 'BEGIN{max=0;min=512} { if (max < $1){ max = $1 }; if(min > $1){ min = $1 } } END{ print max, min}' 

Answer 4

Nếu tập tin của bạn chứa dòng rỗng, không ai trong số các giải pháp được đăng sẽ làm việc. Khi phải xử lý đúng dòng rỗng thử điều này:

$ cat f.awk 
BEGIN{getline;min=max=$6} 
NF{ 
    max=(max>$6)?max:$6 
    min=(min>$6)?$6:min 
} 
END{print min,max} 

Sau đó chạy lệnh này:

sed "/^#/d" my_file | awk -f f.awk 

Lúc đầu, nó bắt dòng đầu tiên của file để thiết lập min và max. Hơn đối với mỗi dòng không trống, nó sử dụng kiểm tra toán tử ternary, nếu tìm thấy min hoặc max mới. Vào cuối kết quả ist in.

HTH Chris

Answer 5

awk 'BEGIN {max = 0} {if ($6>max) max=$6} END {print max}' yourfile.txt 

Answer 6

min có thể được tìm thấy bằng cách:

awk 'BEGIN {min=1000000; max=0;}; { if($2<min && $2 != "") min = $2; if($2>max && $2 != "") max = $2; } END {print min, max}' file 

chí này sản lượng tối thiểu và tối đa, được phân tách bằng dấu phẩy