Có cách nào để gọi chức năng định nghĩa trong một tập tin nói myfunc.rGọi chức năng Custom từ Python sử dụng rpy2
---------------myfunc.r --------------
myfunc = function(){
return(c(1,2,3,4,5,6,7,8,9,10))
}
getname = function(){
return("chart title")
}
---- Python
How to call getname() here ?
Bất kỳ trợ giúp sẽ được đánh giá cao?
Bạn có thể làm một cái gì đó như thế này (mã python đây)
import rpy2.robjects as robjects
robjects.r('''
source('myfunc.r')
''')
r_getname = robjects.globalenv['getname']
sau đó bạn gọi nó là
r_getname()
Điều này vẫn làm việc cho tôi trong năm 2016 với 'R-3.2.2' và' rpy2 = 2.7.0' :) –
Các là các tính năng trong rpy2 rằng sẽ giúp làm này sạch hơn bán phá giá đối tượng vào toàn cầu không gian làm việc.
from rpy2.robjects.packages import STAP
# if rpy2 < 2.6.1 do:
# from rpy2.robjects.packages import SignatureTranslatedAnonymousPackage
# STAP = SignatureTranslatedAnonymousPackage
with open('myfunc.r', 'r') as f:
string = f.read()
myfunc = STAP(string, "myfunc")
Hiện tại, đối tượng trong tệp R có thể được truy cập với myfunc.myfunc và myfunc.getname.
Kiểm tra tài liệu về importing arbitrary R code as a package (tài liệu cũ here).
'SignatureTranslatedAnonymousPackage' Tên là một chút dài tôi nghĩ .. cho R và python develoopers :) – agstudy
Có , có thể nằm trên đầu lộng lẫy Java của phổ đặt tên nhưng vẫn dưới 140 ký tự ;-). Một tên lớp ngắn hơn trong khi giữ nó rõ ràng sẽ có nghĩa là giới thiệu một gói con. Đề xuất cho tên cũng được chào đón. – lgautier
Tất nhiên tôi đến từ thế giới .net và tôi biết ý bạn là gì. rpy2 là một công việc tuyệt vời. Tôi đánh giá cao. +1 .. tên dài nhưng giải pháp sạch sẽ! Tôi nghĩ bạn chỉ có thể thêm 'Import SignatureTranslatedAnonymousPackage thành STAP' chẳng hạn ... – agstudy
tôi muốn đề nghị sử dụng những gì user3282437 gợi ý here:
import rpy2.robjects as robjects
r_source = robjects.r['source']
r_source('/path_to_file/myfunc.R')
r_getname = robjects.globalenv['getname']
Tôi không chắc chắn rằng đó là một vấn đề toàn cầu, nhưng trên Windows máy gọi trực tiếp của tôi như agstudy khuyên:
import rpy2.robjects as robjects
robjects.r('source("some_file.R")')
dẫn đến sự cố trăn.
Tại sao bạn xác định 'myfunc' ở đây? – agstudy
@agstudy: chỉ là một ví dụ cho thấy tệp có thể chứa một số hàm, tôi nghĩ vậy. – lgautier