Vẽ và lưu biểu đồ R

Question

Tôi có tập lệnh bash theo dõi việc sử dụng bộ nhớ theo thời gian khi lệnh được chạy. Nó sinh ra lệnh mong muốn và sau đó viết một bản ghi với column1 = "bộ nhớ được sử dụng bởi chương trình (biểu diễn)" và cột 2 là thời gian trôi qua trong vài giây. ví dụ.

31.282 1470 
31.565 1480 
31.848 1490 
31.989 1500 
32.273 1510 
32.414 1520 
32.697 1530 
32.980 1540 
33.122 1550 
33.405 1560 
6.511 1570 
6.935 1580 
7.502 1590 
7.926 1600 
8.351 1610 
8.775 1620 
9.059 1630 
9.483 1640 
9.908 1650 
10.333 1660 

Những gì tôi muốn làm là chờ đợi cho đến khi quá trình hoàn tất và sau đó sử dụng R để vẽ một đồ thị sử dụng bộ nhớ theo thời gian và lưu nó trong thư mục hiện hành. Tôi đã chơi đùa với R và tôi biết chính xác những lệnh nào tôi cần sử dụng:

> heisenberg <- read.csv(file="4644.log",head=FALSE,sep=" ") 
> plot(heisenberg$V2,heisenberg$V1,type="o",col="red",main="Memory Usage Over Time",xlab="Time (seconds)",ylab="Memory (gigabytes)") 
> text(max(heisenberg$V2),max(heisenberg$V1),max(heisenberg$V1)) #Displays max value 

Nhưng phần tôi đang mắc kẹt là lưu biểu đồ dưới dạng jpg hoặc png. Hoặc làm thế nào tôi có thể thực hiện lệnh này trong kịch bản bash của tôi. Tôi có hoàn toàn cần phải có một kịch bản được viết bằng ngôn ngữ R và chạy nó? Điều này có thể làm tất cả trong một?

---

Sửa

Đây là mã cho script.r tôi

png("mem_usage_2965.png",height=800,width=800) 
heisenberg <- read.csv(file="2965.log",head=FALSE,sep=" ") 
plot(heisenberg$V2,heisenberg$V1,type="o",col="red",main="oases_k85",xlab="Time (seconds)",ylab="Memory (gigabytes)") 
text(max(heisenberg),max(heisenberg),max(heisenberg)) 
dev.off() 

bất cứ ai có thể giúp giải thích tại sao các văn bản không in giá trị lớn nhất trong png outputted? Tôi đang gọi nó trong một tập lệnh bash như R CMD BATCH script.r script.out

Answer 1

Quấn cốt truyện của bạn gọi vào:

jpeg("myplot.jpg") 
....plot code here.... 
dev.off() 

hoặc

png("myplot.png") 
....plot code here.... 
dev.off() 

Xem trang trợ giúp tương ứng của họ: ?png để biết chi tiết các đối số khác.

Đối với một PNG này sẽ là:

png("my_plot.png", height = 800, width = 600) 
plot(heisenberg$V2,heisenberg$V1,type="o",col="red",main="Memory Usage Over Time",xlab="Time (seconds)",ylab="Memory (gigabytes)") 
text(max(heisenberg$V2),max(heisenberg$V1),max(heisenberg$V1)) #Displays max value 
dev.off() 

Đối với hoạt động này trong một kịch bản bash, bạn cần phải gọi R để chạy kịch bản của bạn chứa mã R để tải dữ liệu và rút ra những âm mưu. Đối với điều này có một số tùy chọn, hai là:

R CMD BATCH --no-save --no-restore my_script.R 

hoặc sử dụng Rscript

Rscript my_script.R 

nơi my_script.R là một file văn bản chứa mã R cú pháp hợp lệ cần thiết để sản xuất lô.

Answer 2

Bạn chỉ cần nhìn đơn giản? http://stat.ethz.ch/R-manual/R-devel/library/grDevices/html/png.html

về cơ bản bạn nói với R để bắt đầu tiết kiệm một .png với:

png(file="blah.png") 

sau đó sử dụng:

dev.off() 

để trở lại bình thường.