lỗi biên dịch g ++: không xác định tham chiếu đến hàm thư viện được chia sẻ tồn tại

Question

Gần đây, tôi đã cài đặt thư viện hdf5 trên máy ubuntu và hiện đang gặp sự cố khi liên kết với các chức năng được xuất. Tôi đã viết một kịch bản thử nghiệm đơn giản readHDF.cpp để giải thích vấn đề này:

#include <hdf5.h> 

int main(int argc, char * argv[]) 
{ 
    hid_t  h5_file_id = H5Fopen(argv[1], H5F_ACC_RDWR, H5P_DEFAULT); 
    return 0; 
} 

Lệnh compile là

g++ -Wl,-rpath,$HOME/hdf5/lib -I$HOME/hdf5/include \ 
    -L$HOME/hdf5/lib -l:$HOME/hdf5/lib/libhdf5.so readHDF.cpp 

mà trả về lỗi sau

/tmp/cc6DXdxV.o: In function `main': 
readHDF.cpp:(.text+0x1f): undefined reference to `H5check_version' 
readHDF.cpp:(.text+0x3c): undefined reference to `H5Fopen' 
collect2: ld returned 1 exit status 

Tôi đang bối rối vì lệnh nm dường như cho biết chức năng đã được xuất:

nm -C $HOME/hdf5/lib/libhdf5.so | grep H5check_version 

trả về

0000000000034349 T H5check_version 

và một kết quả tương tự cho H5Fopen. Bất kỳ suy nghĩ về những gì có thể sẽ sai? Bạn không chắc chắn nếu nó giúp, nhưng nếu tôi nhận xét ra phần H5Fopen của kịch bản, sau đó nó biên dịch tốt:

#include <hdf5.h> 

int main(int argc, char * argv[]) 
{ 
hid_t  h5_file_id;// = H5Fopen(argv[1], H5F_ACC_RDWR, H5P_DEFAULT); 
return 0; 
} 

Cũng có nhiều phiên bản của hdf5 cài đặt trên máy chủ được sử dụng bởi các module python khác nhau như h5py và bảng, nhưng tôi không thể nhận được bất kỳ của họ để làm việc, vì vậy tôi đã cài đặt phiên bản này trong thư mục địa phương của tôi và thay đổi các tùy chọn rpath cho g + + linker.

Answer 1

Ok, giải quyết. Vấn đề nằm ở vị trí của lệnh -lhdf5 trong lệnh biên dịch. Rõ ràng -lhdf5 nên được đặt sau readHDF.cpp. Ví dụ: g++ -Wl,-rpath=$HOME/hdf5/lib -L$HOME/hdf5/lib -I$HOME/hdf5/include readHDF.cpp -lhdf5 sẽ biên dịch không có vấn đề gì, nhưng g++ -Wl,-rpath=$HOME/hdf5/lib -L$HOME/hdf5/lib -I$HOME/hdf5/include -lhdf5 readHDF.cpp sẽ không thành công với các lỗi tham chiếu không xác định. Thật thú vị, đây chỉ là một vấn đề đối với Ubuntu 12.04, vì cả hai lệnh biên dịch đều làm việc cho Ubuntu 10.04.

Tìm thấy câu trả lời với lời giải thích tại bài đăng này:

undefined reference to symbol even when nm indicates that this symbol is present

Tôi đoán đặt -lXXX sau khi kịch bản là thực hành an toàn hơn.

Answer 2

Bạn quên đặt -lhdf5 trong lệnh biên dịch. Ngoài ra, không cần cho -l:$HOME/hdf5/lib/libhdf5.so

này nên làm việc: $ g++ -Wl,-rpath,$HOME/hdf5/lib -I$HOME/hdf5/include -L$HOME/hdf5/lib -lhdf5 readHDF5.cpp

Answer 3

Đây không phải là lỗi. Xem C++ shared library undefined reference to `FooClass::SayHello()'

"phiên bản gần đây của GCC reuqire mà bạn đặt các tập tin đối tượng và thư viện theo thứ tự mà chúng phụ thuộc vào nhau ..."